谁知此石自经锻炼之后，灵性已通，要一僧一道带他脱离险境，到温柔之乡去安家乐业，享受荣华富贵，于是才由那癫僧大展幻术，念咒书符，将一块大石变成了扇坠大小，可托于掌上的一块鲜明莹洁的“宝玉”，并在这块“宝玉”的正面镌刻上了“莫失莫忘，仙寿恒昌”；在“宝玉”的反面镌刻上了“一除邪祟，二疗冤疾，三知祸福”。这样，石头就变成了“通灵宝玉”。
理一理贾宝玉与这块玉的关系吧。贾宝玉原来是天界赤瑕宫的神瑛侍者，有一天凡心偶炽，想乘凡界太平盛世去游历一番，就在警幻仙子案前报了名。
而西方灵河岸上三生石畔，有绛珠草一株，因有神瑛侍者日日甘露灌溉，得久延岁月，后修成个女体。只因尚未报答灌溉之恩，五内便郁结着一段缠绵不尽之意。听说神瑛侍者要下凡，也去警幻仙子案前报了名。
茫茫大士闻知这一对风流冤家尚未投胎入世，趁此机会，就将此石头夹带于中，一起来到人间。
例三，《石头记》第一回“甄士隐梦幻识通灵，贾雨村风尘怀闺秀”中，有一段道人、僧人和甄士隐有关“蠢物”的对话：
在这里，贾宝玉是“蠢物”。
例五，《石头记》第六回“贾宝玉初试云雨情，刘姥姥一进荣国府”中，有这样一段话：
在这里，《石头记》的作者是“石头”“石兄”“蠢物”。
例六，《石头记》第十七回“大观园试才题对额，荣国府归省庆元宵”中，有这样一段话：
例七，《石头记》第十七回“大观园试才题对额，荣国府归省庆元宵”中，有这样一段作者的自白：
在这里，《石头记》原作者是“蠢物”。
例八，《石头记》第八回“比通灵金莺微露意，探宝钗黛玉半含酸”中写道：
在这里，通灵宝玉是“石兄”。
例九，《石头记》第八回“比通灵金莺微露意，探宝钗黛玉半含酸”中写道：
宝玉吃了半碗茶，忽又想起早的茶来，因问茜雪道：“早起泡了一碗枫露茶，我说过那茶是三四次后才出色的，这会子怎么又泡了这个茶来？”
此系身前身后事，倩谁记去作奇传？
曹雪芹一生最惭愧的事情，就是他无材补天。请注意，是“无材”不是“无才”。什么是“无材”？“无材”就是不是那块材料；什么是“天”？“天”就是朝廷。封建时代的读书人以做天子门生、为天子效力为人生理想。不能“补天”就是不能为皇家所用。曹雪芹的祖父曹寅曾任江宁织造，康熙皇帝南巡时曹家四次接驾。很多红学家认为曹雪芹的父亲是曹頫，他做江宁织造时被雍正皇帝抄家，曹家从此走向末路。曹雪芹既不能继承祖父的官职，也不能通过科举考试获得功名。在那个时代，读书做官是读书人唯一的出路。没有出路，多么郁闷。曹雪芹无材可以补苍天，就把自己幻化成一块石头写小说。这就是《红楼梦》又叫《石头记》的原因。
相似的例子我们在其他文学作品中也可以找到，如《巴黎圣母院》《瓦尔登湖》等都是用地名作书名；《西厢记》《水浒传》则是用地理概念作书名。实际上用地名、人名、事件名来命名书籍的现象在各国文学史上层出不穷：《柳毅传》《虬髯客传》《唐·吉诃德》《羊脂球》等都是如此。
从文学层面解释“石头记”这三个字，更是精妙。首先小说中主人公的名字就和“石”紧密关联。古人起名非常讲究，音、形、意三者合一方为绝佳。除此之外，“名”和“字”之间也会存在相对或者类同的现象。比如岳飞的“名”和“字”就喻指相似意象——高山耸立，坚定执着；大鹏飞升，志向高远。班固字“孟坚”，其中的“孟”表长幼，“固”和“坚”则相辅相成。类似现象在国学造诣深厚的金庸身上也有体现，他笔下的“杨过”（字改之）、“谢逊”（字退思）都是此中佼佼者。
《胭脂斋重评石头记》中说，贾宝玉是神瑛侍者转世，他在赤霞宫当值时浇灌了一株绛珠仙草，随后神瑛下凡时仙草也跟着坠入人间，以图报恩。红学研究者认为，贾宝玉出生时口中所含美玉就是无稽崖下的补天石，它在贾、林二人的爱情悲剧中扮演了见证者的角色。
除此之外，贾府上下对奇花异石的偏爱也存在着神秘的隐喻。小说中有多处关于贾府园林的描写：“下面白石台阶，凿成西番莲花样。”“雪白粉墙，下面虎皮石，随势砌去，果然不落富丽俗套。”“白石崚嶒，或如鬼怪，或如猛兽，纵横拱立。”奇花异石虽然美不胜收，但它们不能满足人们对生活的需求。若干年后，贾府败落，曾经欢歌一片的假山石林也随之一片萧条。可以说，贾府后花园的石山石海和贾宝玉的人生经历形成另一种对照，二者一荣俱荣，一辱俱辱。
当然，以大众的观点而言，“石头记”三字过于平淡——即便它有着深刻的寓意，发现者也找到了更富话题性、更具思想外延的“红楼梦”三个字来代替它。有人说《红楼梦》得名于悼红轩，也有人说这是通览全文之后的概括性命名，不过以上种种都与“石头记”三字无关了。我们需要知道的是，“石头记”并非即兴而起的简单名称，它背后实际上隐藏着诸多深刻原因。